斯坦福大学遗传学系主席也来杭州创业了!

2017-05-27 00:00:003154

对,你没看错!落户在杭州滨江的星迈科技,是硅谷高科技公司SensOmics在中国的总部,公司创始人Michael Snyder教授,还是斯坦福大学遗传学系主席。除了他,这个团队还有一串的牛逼世界级专家……据说,这个公司还怀揣着一个世界级的牛逼使命:要将当前最前沿的人工智能和机器学习技术融入于基因组大数据的解读和分析之中从而为精准医学与精准健康提供一个定量化与规范化的框架。更加牛逼的是!这个项目是由杭州高科技投资有限公司下属的杭州硅谷孵化器搭桥牵线引入。此为硅谷孵化器引进系列之二。

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2017年5月17日,由SensOmics(星迈科技)主办的精准医学高端研讨会在位于公司所在地杭州市国家高新技术开发区的亚科中心举行。星迈科技的联合创始人Michael Snyder教授(斯坦福大学遗传学系主席),张兆雷教授(多伦多大学医学院分子遗传学系和计算机系)和李晶晶博士(斯坦福大学医学院基因组中心和儿科系)分别发表了精彩的学术报告,纵论精准医学的临床前景。

与此同时中山大学国家中组部青年千人,担任中山大学基因工程国家教育部重点实验室主任的张锐教授也代表国内同行,展示了杰出的科研成果。参加会议和研讨的嘉宾有来自浙大附属儿童医院,浙大附属妇产科医院、浙大附属第一医院、浙大附属第二医院、清华大学、浙江大学、和中山大学等各单位的临床医生,科研人员,管理专家和大健康产业的当地投资机构代表。

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会议海报

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  斯坦福大学遗传学系主席Michael Snyder教授

SensOmics(星迈科技)这次举办的研讨会采用小范围定向邀请参与的形式进行,旨在和国内外同行深入介绍和交流精准医学在临床的实践和方法。在本次会议中,SensOmics(星迈科技)展示了和浙大附属儿童医院合作研究的科研成果,并作了详尽的临床病例分析。其中包括一名来自浙江衢州的今年年初就诊于儿童医院的病童。该病例临床显示婴儿痉挛症,并伴有发育迟缓,耳聋,视觉障碍等多种症状,从而临床未能依据症状给予确诊。SensOmics和儿童医院的临床医生紧密合作,对该患儿的基因组进行了全面分析。通过大规模智能集成计算的全面解读,确认该患儿在RAI1和NF1两个重要基因位点存在致病突变,因此临床表现极其罕见的Smith-Magenis Syndrome和Neurofibromatosis的复合症状。这些临床案例的分析展示了SensOmics(星迈科技)在疾病基因组分析的专业和实力,同时也证明了精准医学在未来临床诊断和治疗等各方面不可或缺的重要地位。

公司的联合创始人朱李晨先生介绍,SensOmics由斯坦福大学遗传学系的Michael Snyder教授,加拿大多伦多大学的张兆雷教授,斯坦福大学儿科医学系的李晶晶博士,硅谷工程师、企业家朱李晨先生联合创立。公司旨在开发高通量实验方法和大规模智能计算框架以实现人类复杂疾病基因组的精准解读。公司于2016年获得滨江区政府的重点支持,2017年落户于钱塘江畔的亚科中心。

SensOmics的联合创始人,斯坦福大学医学院遗传学系系主任兼任基因组及其个体化医学中心主任Michael Snyder教授,做了远程主题演讲:Managing Health and Disease Using Omics and DigData。

Snyder教授为基因组学,精准医学,高通量生物技术等领域的世界级领袖,并为精准医学概念的奠基人之一。他的团队曾经发明或者共同发明多项广泛应用的基因组学技术,例如RNA-Seq, Protein Array, Genome Tiling Array。Snyder教授的研究团队2012年在Cell杂志上发表了一个精准医学方面里程碑式的开创性工作,在世界上首次利用了可穿戴器材(wearable),蛋白质质谱技术,二代测序技术,跟踪测量了一位实验志愿者(Snyder教授自己)14个月的时间。在一年多的时间内,Snyder教授在固定的间隔时间内测量了他本人的多项生理参数包括体温,心跳,血糖,血脂,代谢谱,细胞因子(cytokine)等等。

同时他又定期采集了自己的血样,测量了mRNA与microRNA的表达谱。这些海量的生理与基因组学的时间序列数据,被进一步地与Snyder教授本人的全基因组序列结合起来进行大数据分析,进而用来解释Snyder教授本人的健康状况。

经过先进的大数据与机器学习(machine  learning)分析方法,Snyder教授的团队成功地预测到了Snyder教授具有患有糖尿病的高风险,并确诊了一次莱姆病的发病史(LymeDisease)。在本次会议上,Snyder 对精准医学这个概念的临床实体化做了形象地展示,充分展示了在大数据时代,临床医学即将面临的巨大变革。

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Snyder教授科学报告

接承Snyder教授的演讲,来自斯坦福大学医学院儿科学系的李晶晶博士将精准医学的理论具体化到大规模的临床案例分析。他发表了Large-Scale Genome Analysis: From Big Data to Clinical Practice的讲演,并系统地阐述了大规模基因组分析如何正深刻地影响着临床的理论和实践。李博士介绍了斯坦福大学在精准医学的前沿进展,同时以自闭症为例,展示了突破传统的Genome-wideassociation study (GWAS)的必要性和开发大规模基因组分析新方法的重要性。

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李晶晶博士在自闭症基因组学方向的研究成果


星迈科技的另一位发起人,来自多伦多大学医学院的张兆雷教授介绍了他在多伦多的团队利用二代测序分析进行急性与慢性白血病患者中癌症复发与耐药性的前瞻预测。张兆雷教授在加州大学伯克利分校获取博士学位,后来在耶鲁大学进行博士后研究,现在多伦多大学的分子遗传学系及其计算机系担任正教授。张教授介绍了基于100名慢性白血病患者(Chronic Myeloid Leukemia, CML)的靶向基因测序研究(panel sequencing), 将发现的基因突变分为四类,根据基因突变序列谱,成功地预测了慢性白血病患者对伊马替尼(imatinib)的抗药性。在另一个项目中,张教授的团队跟踪了104名患有急性白血病(Acute Myeloid Leukemia, AML)并接受了异体造血干细胞移植的患者,在干细胞移植手术钱与手术后提取了骨髓样本并进行了靶向测序。研究结果显示,患者在干细胞移植21天后的基因突变频率可以用来比较准确滴预测白血病复发的几率。这些研究结果在临床白血病治疗中有极其宝贵的应用。  

与前面介绍的基因组分析不一样,来自中山大学的张锐教授介绍了人类转录物组在复杂疾病的作用。在真核细胞包括人类细胞组织中,mRNA会经过多次修饰,包括张锐教授重点研究的A-I(Adenosine-to-inosine) editing. 张锐教授的前期工作证明多数人类基因会经过A-Iediting ,并且此类修饰在各类组织和细胞系中具有特异性。张锐教授在中山大学的团队的最新结果显示此类RNA修饰在发展癌症早期检测的新方法,开发新的抗癌药物中具有极大用途。 张锐教授现为国家中组部青年千人,担任中山大学基因工程国家教育部重点实验室主任。在回国以前,张锐教授在斯坦福大学从事博士后研究。 
四位专家报告之后,与会代表在精准医疗应用方面展开了积极热烈的讨论。浙江大学公共卫生学院的朱善宽院长根据自己多年来的人群队列研究成果,阐述了在精准医学在公共卫生领域中的实践用途。来自杭州各大医院的医疗专家也交流了各个单位在基因测序分析方面的设想与实施方案,各位专家也表示了今后与星迈科技团队在科研与产业化等多个方向的广阔合作前景。高新区当地政府人才办主要负责人也莅临会场,表示对公司的发展的全面支持。研讨会后,与会专家参观了星迈科技在亚科中心的实验室与办公场所并合影留念。 

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与会专家合影(左七为杭州市高科技投资有限公司董事长周恺秉)